あんましマイクロソフトさんはMacについて力入れてないのかわかんないですけど、残念ながら、OneNote 2016 for Macでは手書き入力はできません。マウスでお絵かきですらできないんです。
図形描画もないんですよね。なんでWindows版にはちゃんとあるんでしょうか?
アップル製品愛好家がOneNoteで手書きをするならiPadでやってね、というスタンスなんでしょうか?
OneNote for iPadっていうかiOSのアプリは手書き入力、筆圧にも対応していた気がします。iPadに対応したペンを使えば結構使えるかもしれません。
◆ 2016/08/11 追記 ◆
現在はできるようになりました。